Trẻ sơ sinh và trẻ mới biết đi vẫn mắc chứng rối loạn tiêu chảy khá phổ biến ngay cả ở các nước phát triển. Theo tổng quan dịch tễ học gần đây, tỷ lệ mắc bệnh hàng năm dao động trong khoảng 0,5 đến 2 đợt trên mỗi trẻ dưới 3 tuổi ở Châu Âu. Nguyên nhân phổ biến nhất ở các nước phát triển là virus.

Ở trẻ sơ sinh và trẻ em dưới 5 tuổi, bệnh tiêu chảy do virus này chủ yếu do rotavirus và norovirus gây ra. Tuy nhiên, nhờ sử dụng rộng rãi vắc xin rotavirus, sự phân bố của các mầm bệnh virus đã thay đổi.

Ngày nay, số ca nhiễm rotavirus ít hơn nhưng số ca nhiễm norovirus lại nhiều hơn. Vi khuẩn gây bệnh chủ yếu gây viêm dạ dày ruột có thể là Campylobacter hoặc Salmonella, tùy thuộc vào quốc gia. Theo các công bố khoa học, mầm bệnh có thể được phát hiện trong tổng số 45-75% trẻ em bị viêm dạ dày ruột cấp tính (ESPGHAN 2014).